億利天然藥業集團下屬企業包括：鄂爾多斯市億利醫藥有限責任公司、內蒙古億利能源股份有限公司藥業分公司、內蒙古億利能源股份有限公司甘草分公司、包頭中藥有限責任公司、庫倫蒙藥廠、包頭同惠醫藥公司、陜西華信醫藥有限公司、鄂爾多斯市維康醫藥有限公司、北京信海豐園醫藥等9家分子公司。